Comedia fantástica acerca de un marionetista que, pese a su talento, está por tocar fondo tanto en su trabajo como en su matrimonio. El hombre comienza a trabajar como archivista en una empresa, donde se siente atraído por una seductora mujer que, sin embargo, lo rechaza. Casualmente, encuentra un pasadizo por el que accede al cerebro de John Malkovich.
El film marcó el debut en la dirección del talentoso Spike Jonze -responsable de muchos videoclips de los Beastie Boys y de otras bandas de rock de primera línea- y fue producido por Michael Stipe, líder de grupo REM.